PCR實驗室基礎知識
為了對以個特定序列進行PCR做重複檢測,需要三個不同的區域,每一個區域的具體技術操作(zuò)和試劑在(zài)下(xià)麵詳細列出
1、樣品準備區
這個區域專門(mén)用作樣品的準備,在(zài)製備和操作用於核酸提取的試劑時應該采
取預防措施:
1)PCR產物和(hé)帶有要(yào)擴增(zēng)序(xù)列的DNA克隆不能在這(zhè)個房(fáng)間操(cāo)作。
2)組織(zhī)培養物、組織(zhī)標本和血清樣品都帶進樣品準備間處理,以根(gēn)據應用的需要提取DNA或RNA。
3)用於樣品處理的工具不能被用作普通分(fèn)子克隆的工具,也不(bú)能用作操作靶序列。
4)DNA樣品應該用(yòng)有專門的防護或正壓活塞式移液管(guǎn)操作,以防止在吸取樣品時有氣溶膠遺留。
5)大體積樣品應該用單獨包裝的無菌一次性移液管吸取。
6)管子打開(kāi)前都要簡短離心以減少氣溶膠的產生,而且管子不能用力崩開,這樣會產(chǎn)生氣溶膠。
7)任何時候都應該穿實(shí)驗服和帶手套,手套要經常更換,尤其(qí)在抽提過程中每一步之間都要更換(huàn)。實驗服要專門用於樣品準備間(jiān),經常清洗。
2、樣品準備(bèi)和RNA-PCR
RNA-PCR的額外步驟需要額外的樣品操作,這樣增加了樣品之(zhī)間汙染的機會。
3、前PCR區
必須有專門用於準備(bèi)各種反應的區(qū)域,這個區域必須保持幹淨(jìng),而且沒有來自克(kè)隆和樣品準備的汙染。前PCR區必(bì)須要有試劑和準備,特別是專門用於前PCR區的正壓活塞式移液管。
4、PCR實(shí)驗室(shì)試劑的操作
1)所(suǒ)用的(de)所有溶液都應該沒有核酸和(或)核酸酶(DNase和RNase)汙(wū)染。
2)所有PCR試劑中使用的水都應該是高質量的-新(xīn)鮮蒸餾的去離子(zǐ)水,用0.22μm過濾的,並(bìng)且(qiě)是高壓滅菌。
3)在20℃到25℃貯(zhù)存的試劑建議加點像疊(dié)氮鈉一類的抗微生物劑,在擴增試劑或樣品製備試劑中加入0.025%的疊氮鈉不抑製擴(kuò)增反應。
4)所用試劑都應該以(yǐ)大體積配製(zhì),實驗一下看試(shì)劑是否滿意,然(rán)後分裝成僅夠一次使用的量進行貯(zhù)存。
5)所有試劑和樣品準備過程中都要使用一(yī)次性滅菌的瓶子和管子。
6)新配製的試劑在用於準備新的標本之(zhī)前應(yīng)該加以檢驗。
7)樣(yàng)品準備(bèi)和前PCR區所(suǒ)使用的移液管(guǎn)在(zài)不使用時都應該小心(xīn)保存(cún)。
5、在前PCR區建立PCR混合物
1)可以把即刻可(kě)用的“主混合(hé)物”溶液配好、分裝(zhuāng)並保存在-20℃或(huò)4℃,在實驗(yàn)室隻涉及到擴增一種或少數幾種特異序列時這樣做很有用。
2)如果你的實驗室使用多套引物,以致於配製(zhì)包括所有試劑的單一反應混合物不夠經濟(jì),可以(yǐ)考(kǎo)慮分裝保存(cún)夠一天的PCR成分。
3)作為一個規則,應該保(bǎo)存一套陰性、弱陽性和強陽(yáng)性(xìng)對照樣品來分析樣品配製和PCR前過程的效(xiào)率和潔(jié)淨程度。而且,你也希望通過使用一個已知的(de)弱陽性樣品來驗證你(nǐ)的樣品緩(huǎn)衝液以證明裏麵不含擴增抑製物。