PCR實驗室建設方案、規劃設計
PCR實驗室又叫基因擴增實驗室。PCR是聚合酶鏈式反應(PolymeraseChainReaction)的簡稱。是一種分子生物學技術(shù),用於放大特定的DNA片段,可看(kàn)作生物體外的特殊DNA複製。通過DNA基因追蹤係(xì)統,能迅速掌握患者體(tǐ)內的病毒含量,其精確度高達(dá)納米級別(bié),精確(què)檢測乙肝病毒在患者體內存在的數量、是否複製、是否傳染、傳染性有多(duō)強、是否必(bì)要服藥、肝功能有否異常(cháng)改變能及時判斷病人最適合使用哪類抗病(bìng)毒(dú)藥(yào)物、判斷藥物(wù)療效如何、給臨床治療提(tí)供了可靠的(de)檢驗依據。
開展PCR實驗室應具備(bèi)的(de)條件
1、必須擁有標準的的PCR熒(yíng)光實驗室;
實時熒光定量(liàng)PCR技術於1996年由美國AppliedBiosesystems公司推出 由於該技術不僅實現了PCR從定性到定量的飛躍,而且(qiě)與常規(guī)PCR相比,它有(yǒu)特異性更強、有效解決PCR汙染問題、自動化程度高等特點,目前(qián)已得到廣泛應用。
2、檢測設備必須符合(hé)標準PCR熒(yíng)光實驗室設置要求;
熒光定量PCR儀(yí)+實時熒光定量試劑+通用電腦(nǎo)+自動分(fèn)析軟件,構成PCR-DNA/RNA實時熒光定量檢測係統。
3、必須通過國家臨床檢驗中心的驗收和(hé)認證;
4、檢測人員必須通過(guò)國家臨檢(jiǎn)中心業務培訓並取得合格證書(shū);
PCR實驗室內工(gōng)作人員必須參加由(yóu)國家衛(wèi)生部或各省(shěng)臨床檢驗(yàn)中心舉辦的臨床基因擴增培訓班,並持證上崗。PCR實驗室通過驗收(shōu),實驗室至少必須應有兩個以上(shàng)持有“臨床基因檢測上崗證”。PCR實驗室必須建立嚴格的實驗室管理(lǐ)製度、建立(lì)標準化操作程序(SOP)、建立係列質量(liàng)管理(lǐ)文件等,確保實驗室日常運行符合國家衛生部的要求,確保檢測結果準確、確保實驗室(shì)衛生安全,確(què)保實驗室長期穩定運行
5、必須在無菌無塵環境下進行操作
下麵介紹如何建(jiàn)立PCR實驗室
1、建立樣品準備區
這個區域專門用作樣品的準備,在製備和操作用於核酸提取的試劑時應該采取預防措施:
⑴PCR產物和帶有要擴增序列的DNA克隆不(bú)能在這個房間操作。
⑵組織培(péi)養物、組織標本和血清樣品都帶進樣品準備間處(chù)理,以(yǐ)根據應用的需(xū)要提取(qǔ)DNA或RNA。
⑶用於樣品處理的工具不(bú)能被用作(zuò)普通分子克隆的工具,也不能用作操(cāo)作靶序列。
⑷DNA樣品應(yīng)該用有專門的防護或正壓活塞式移液管操作,以防(fáng)止在吸取樣品時有氣溶膠遺留。
⑸大體(tǐ)積樣品應該用單獨(dú)包裝(zhuāng)的無菌一次性移液管吸取。
⑹管子(zǐ)打(dǎ)開前都要簡(jiǎn)短離心以減少氣溶膠的產生,而且管子不(bú)能用力崩開,這樣會(huì)產生氣溶膠。
⑺任何時候都應該穿實驗服和帶手套,手套要經常更(gèng)換,尤(yóu)其在抽提過(guò)程中每一步之間都要更(gèng)換。實驗服要專門用(yòng)於樣品準備間,經常清洗。
2、樣品準備和RNA-PCRRNA-PCR的額外步驟需要額外的樣品(pǐn)操作,這樣增加(jiā)了樣品之間汙染的機會。為了避免這一問題,反轉錄一步可(kě)以(yǐ)在樣品準備區進行。在RNA-PCR中應用UNG以防止汙染的方法也有報道。
3、建立前PCR區。
該去專(zhuān)門用於準備各種反應,這個區域必須保持幹淨,而(ér)且沒有來自克隆和樣品準備的汙染。前PCR區必須要有試劑和準備,特別(bié)是專門用於前PCR區的正壓(yā)活塞式移(yí)液管。
4、PCR實驗(yàn)室試(shì)劑的操作。
⑴所用(yòng)的所有溶液都應該沒有核酸和(或(huò))核酸酶(DNase和RNase)汙(wū)染。
⑵所有PCR試劑中使用的水都應該是高質量的-新鮮蒸餾的去(qù)離子水,用0.22μm過濾的,並且是高壓滅菌。
⑶在20℃到25℃貯存的試劑建議加點像疊氮鈉一類的抗微生物劑,在擴增試劑或樣品製備試劑中加入0.025%的疊氮鈉不抑(yì)製擴增反應。
⑷所用(yòng)試劑(jì)都應該以大體積(jī)配製,實驗一下看試劑是否滿意,然後(hòu)分裝成僅夠一次使用的量進行貯存。
⑸所(suǒ)有試劑和樣品準備過程中都(dōu)要使用一次性滅菌的瓶子和管子。
⑹新(xīn)配製的試劑(jì)在用於準備新的標本之前(qián)應(yīng)該加以檢驗。
⑺樣品準備和前PCR區所使用的移液管在不使用時都應該小心保存。
5、在前PCR區(qū)建立(lì)PCR混合物。
⑴可以把即刻可用的“主混合物”溶液配(pèi)好、分裝並保存在-20℃或4℃,在實驗室隻涉及到擴增一種或少數幾(jǐ)種特異序列時這樣做(zuò)很有用。
⑵如果你的實驗室使用多(duō)套引物(wù),以致(zhì)於配製包括所有試劑的單一(yī)反應混(hún)合物不夠經濟,可以考慮分裝保存夠一天的PCR成分。
⑶作為一個規則,應該保(bǎo)存一套陰性、弱陽性和強陽性對照樣品來分析樣品(pǐn)配製(zhì)和PCR前(qián)過程的效率和潔淨程度。而且,你也希望通過使用一個已(yǐ)知(zhī)的弱陽性樣品來驗證你的樣品緩衝液以(yǐ)證明裏麵不含擴增抑製物。
⑷陰性樣品要與每組樣品同時做,以分析是否存在樣(yàng)品與樣品之(zhī)間的汙染(rǎn)以(yǐ)及是否存在PCR產物(wù)的汙染,陰性對照應該包括核(hé)酸以外的所有試(shì)劑。
⑸當做陽性對照時,有兩個理由決定了應該(gāi)使用最少(shǎo)數量(liàng)的(de)核酸。
⑹由(yóu)於必須(xū)有對照(zhào)反應,對照模板的特點應該予以考慮(lǜ)。
6、控製汙染的方法(fǎ)。
已設計出很有力的酶學方法用來消除一種形式的汙染—使用(yòng)UNG,這一技術能有(yǒu)效地消除由PCR產物引起的汙染。另一種控製汙染的方法是使用紫外線,這種方法不能完全消除汙染問題,但可以(yǐ)將汙染(rǎn)降低幾個(gè)數量級。
7、後PCR區PCR完成以後,需要(yào)分析樣品並解釋數據(jù),應該留出一個專(zhuān)門用於反(fǎn)應後處理樣品的地(dì)方。後PCR活動中(zhōng)使用的所用試劑(jì)、一次性耗材和儀器都必須(xū)是專門用(yòng)於這一目的,決不能把實驗室這一區域的(de)試劑或儀器用於(yú)任(rèn)何前PCR活動。